Durante un año funcionó en el local de la esuela Avelino Montes Linaje, hasta después trasladarse al que actualmente ocupa, inicialmente fué creada para dar estudios de bachillerato a los estudiantes del Seminario Menor.

Al morir en un accidente de avión el Mons. Cantón, nuestra escuela adopto el nombre de "Escuela Preparatoria Yucatán Mons. Luis Miguel Cantón Marín" para así hacer honor a la memoria de quien en vida fuese inspiración para esta gran obra.

Ahora 25 años después... la Preparatoria Yucatán, renueva sus fuerzas y se encuentra en un año de intensos cambios... aunque aun conserva aquel objetivo que la originó.... ofrecer a los seminaristas y la población una educación católica, de calidad, centrada en los valores y en la fe.